Forschungsfördernde Organisationen
Neben der Projektförderung durch die Projektträger der Bundesministerien werden Forschungsaufträge auch von forschungsfördernden Organisationen vergeben.

Projektförderung durch die DFG
Die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) fördert Einzelvorhaben, und größere Forschungsverbünde.
Im Zusammenhang mit der Agrobiodiversität ist ein wichtiger aktueller Forschungsschwerpunkt der DFG die Forschungsplattform Biodiversitätsexploratorien.
Zu Biodiversitätsexploratorien
Die DFG hat die Senatskommission Biodiversitätsforschung zur Koordination und Positionierung dieses Themas auf internationaler Ebene eingerichtet.
Projektförderung durch Stiftungen
Die Deutsche Bundesstiftung Umwelt (DBU) fördert Vorhaben zum Schutz der Umwelt. Ein Förderschwerpunkt ist beispielsweise Aquakultur und hier die Etablierung neuer Aquakultur-Spezies.
Die VolkswagenStiftung fördert exzellente Forscherinnen und Forscher als Personen und ermöglicht ihnen damit Fachgrenzen zu überschreiten und sich auch Themen zu widmen, die ihren Wissensgebieten neue Horizonte erschließen. Dieser Förderansatz kann gerade für interdisziplinäre Projekte im Bereich Agrobiodiversität sinnvoll sein.
Die Bauer-Stiftung fördert auch Juniorforschergruppen "Biodiversität“.

