Die wissenschaftlichen Aktivitäten im Geschäftsbereich des BMELV werden - neben der Forschungskoordinierung im Ministerium - durch den Senat der Bundesforschungsinstitute miteinander vernetzt. Dieser Senat besteht aus Vertretern der vier Bundesforschungs-institute (Julius Kühn-Institut, Friedrich-Loeffler-Institut, Max Rubner-Institut und Johann Heinrich von Thünen-Institut), des BfR und der sechs Leibniz-Institute.
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Für den Bereich Biodiversität wurde eine eigene Senatsarbeitsgruppe Biodiversität berufen, deren Aufgabe die bessere Vernetzung der Forschungsaktivitäten auf dem Gebiet der Biodiversität innerhalb und außerhalb der Ressortforschung ist. In der Arbeitsgruppe werden Fragestellungen zur Biodiversität auf unterschiedlichen Ebenen - der genetischen Ebene, der Artebene bis zur Landschaftsebene - untersucht. Die Arbeitsgruppe hat im Jahr 2007 einen Überblick über die Forschungsaktivitäten der Ressortforschung im Bereich Biodiversität erarbeitet, der gerade aktualisiert wird.
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