Die Bundesministerien können neben ihrer Ressortforschung Forschungsaufträge auch an andere Einrichtungen abgeben. Mit dem Management der externen Forschungsprojekte werden Projektträger (PT) beauftragt, die auch in einer nachgeordneter Behörde angesiedelt sein können.
Außerdem werden finanzielle Mittel für die Agrobiodiversitätsforschung von forschungsfördernden Organisationen, wie beispielsweise der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG), und von Stiftungen bereitgestellt.